底床シリーズ（メダカの天然玉土 黒 や 金魚・メダカの大粒珠五色砂利など）は使用前に洗う必要はありますか？

はい。製造時の細かな粉が付着している場合があります。
バケツなどに少量ずつ取り、水がある程度透明になるまで水道水で軽くすすいでからご使用ください（洗剤は使用しないでください）。